Чарльз Фрэнсис Ксавье родился в семье ядерного исследователя Брайана Ксавье и его супруги Шэрон. После несчастного случая, который унес жизнь Брайана, Шэрон повторно вышла замуж. Ее избранником стал коллега старшего Ксавье – Курт Марко. Вскоре после этого, Каин, сын Марко от первого брака, переехал жить в особняк Ксавье, Вестчестер (Westchester). Будучи жестоким и злобным ребенком, Курт стал изводить своего сводного брата. Втайне от всех, Марко наказал сына, сильно\ избив его – молодой Чарльз почувствовал боль брата, как будто все это происходило с ним самим. Таким образом и проявились впервые его способности телепата. После смерти матери, пожар в их родовом поместье унес жизнь Курта. Сводные братья остались без родных.
К тому времени Чарльз уже окончил среднюю школу и лишился своих волос (это было частью его мутации). В возрасте 16 лет он поступил в Bard College, в Нью-Йорке, и в течение двух лет умудрился заслужить звание бакалавра в области биологии.
Затем он был принят в престижную программу исследований при Оксфордском Университете в Англии, где получил ученую степень в области\ генетики и биофизики. Там же Чарльз познакомился и влюбился в молодую шотландку по имени Мойра Кинросс (Moira Kinross). Их страстные обсуждения вопросов генетической мутации уступили место романтике и вскоре влюбленные начали планировать будущий брак. Единственным препятствием был бывший бойфренд Мойры, Джо МакТаггерт (JoeMacTaggert) –ефрейтор в Королевской Морской пехоте, который к тому же был таким же задирой как и Каин. В глазах Джо, Чарльз годился только для чего-то интеллектуального, поэтому Ксавье решил проверить себя в экстремальных условиях и после завершения учебы в Оксфорде ушел на военную службу.
Чарльз быстро стал легендой в области поиска и спасения людей, благодаря своим телепатическим способностям. Поступив в ту же часть, что и его сводный брат, Чарльз стал свидетелем того, как Каин отступил под огнем в ходе миссии в Азии. Пытаясь убедить брата вернуться, Ксавье последовал за ним и присутствовал в тот момент, когда Каин обнаружил мистический Рубин Сyttorak (Ruby of Cyttorak) и превратился в сверхчеловека по имени Джаггернаут (Juggernaut). В тот же момент произошло обрушение и Чарльз бежал, ошибочно полагая, что его сводный брат погиб.
Чарльз был опустошен, когда позднее Мойра оборвала их отношения без каких-либо объяснений. Он ушел из армии и начал путешествовать по миру. В Каире, Египет, Ксавье столкнулся с Амаль Фаруком (Amahl Farouk) – мутантом, способным вызвать тьму в душах других людей. Это противостояние привело Чарльза к решению посвятить свою жизнь защите человечества от злых мутантов и, также, защите мутантом от угнетения обычными людьми.
Чарльз отправился в Израиль, где влюбился в Гэбриэль Хэллер, которая являлась израильским дипломатом. Кроме того, он подружился с человеком по имени Эрик Магнус Лэншер – мутантом, который впоследствии станет его злейшим врагом. Магнето (Magneto), мастер магнетизма. Чарльз оптимистично полагал, что люди и мутанты могут сосуществовать, однако Магнус предвидел иное будущее. Он предсказывал преследования мутантов со стороны людей, которые не могли смириться с существованием одаренных. Двум мутантам удалось помешать Барону Вон Стракеру (Baron Von Strucker), который хотел натравить террористическую группу Гидра (Hydra) на ничего не подозревающий мир. Магнус исчез с золотом Стракера, а Чарльз решил вернуться домой, не зная, что Хэллер ждет от него ребенка, Дэвида.
По пути в Соединенные Штаты, Чарльз столкнулся в Гималаях с инопланетным разведчиком по имени Люцифер (Lucifer). Чтобы предотвратить любые попытки людей сорвать запланированное вторжение на Землю, Люцифер обрушил на Ксавье массивный камень, тем самым лишив мутанта возможности ходить. В отчаянии Чарльз закричал, используя свои психические способности. Это позволило ему «дотронуться» до сознания молодой одаренной по имени Тесса (Tessa), которая действовала в качестве наемника на соседних горах Гиндукуш (Hindu Kush). Тесса пришла Ксавье на помощь и он был доставлен в безопасное место. Во время своего лечения в индийском госпитале, Чарльз встретился с Амелией Вогт (Амелия Voght) влюбился в нее, тем самым вернув себе желание жить.
Чарльз возобновил свою дипломную работу в Колумбийском Университете в Нью-Йорке, и, получив докторскую степень по антропологии, он провел несколько лет в Лондоне, получая опыт в области психиатрии. Там Чарльз возобновил свою дружбу с Мойрой, которая вышла замуж за Джо МакТаггерта и теперь была известным генетиком. Ксавье и Мойра начали обсуждать идею создания школы для мутантов.
Чарльз вернулся в Америку и снова занялся изучением мутации, работая вместе с Доктором Карлом Лукасом (Doctor Karl Lykos), который однажды станет существом по имени Саурон (Sauron). В это время, Профессор Джон Грей, приятель Чарльза еще с момента обучения в колледже, привез свою дочь Джин Грей, чтобы просить Ксавье о помощи. Джин была потрясена, когда телепатически пережила смерть своего друга. Чарльз помогал ей восстановиться, а в последующие годы учил использовать свои умственные способности.
Затем Чарльз встретился с Фредом Дунканом (Fred Duncan), агентом ФБР, который расследовал причину растущего числа мутантов. Чарльз рассказал Дункану о своем плане найти молодых одаренных и предложить им поступление в школу для мутантов. В качестве основной базы использовался особняк Ксавье, в котором готовили ребят использовать их способности на благо человечества. Амелия оставалась с Чарльзом вплоть до того момента, когда в школе появился молодой мутант по имени Скотт Саммерс (Scott Summers). В конечном итоге она ушла, опасаясь, что это может перерасти в генетическую гонку вооружений между Чарльзом и Магнусом.
В течение следующего месяца, Ксавье использовал Церебро (Cerebro), чтобы собрать свою первую группу студентов: Циклоп (Cyclops); Айсмен (Iceman); Ангел (Angel); Зверь (Beast); Джин, которая взяла имя Чудо-Девушка (Marvel Girl). Он назвал свою команду Люди Х (X-Men), потому что в каждом был дар, которым не обладали обычные люди. Чарльз также нанял на работу Тессу, но ее присутствие в особняке оставалось тайным, так как профессор хотел использовать ее таланты в качестве шпиона.
После нелепой случайности, виной которой оказался Хэнк Маккой, молодой Чарльз, равно как и Джин Грей, оказался в будущем, где ему был предоставлен выбор – телепатия или ноги. Стресс и шок от совсем не радужного будущего выбили телепата из колеи, из-за чего тот сделал выбор в пользу ходьбы. С этого момента привычный всем Чарльз Ксавьер исчез и появился новый, столкнувшийся со всеми трудностями 21 века.

Музыка грохотала так сильно, что заглушала мысли других людей. Вот, что в барах нравилось Чарльзу больше всего. Это и еще выпивка, конечно же.
Ксавьер стоял у барной стойки, надеясь получить хотя бы бутылку чего-нибудь алкоголесодержащего, но бармен упорно не замечал молодого человека, предпочитая ему прекрасных и чуть подвыпивших дам, чьи чаевые были выше Эмпайр Стейт Билдинг. Нет, такое можно было понять в любой другой день, но сегодня же у профессора появилась еще одна докторская степень. Шестая! Нет, сегодня был знаменательный день, и тратить его на ожидание внимания со стороны бармена Чарли не желал. И он сделал то, чего бы никогда не совершил будущий основатель школы мутантов, мудрый лидер и наставник. Он влез в голову накаченному бармену (где, кстати, обнаружил кучу ужасно пошлых мыслишек) и заставил его поставить на барную стойку две бутылки пива. Телепат с удивлением заметил, что не почувствовал ни капли стыда, совершив такое. Но списал он это, конечно, на алкоголь.
Повернувшись на 180 градусов, Чарльз обратил внимание на Эрика, сидевшего за их столиком с обычным для мужчины суровым лицом. Как это всегда и бывает, Леншерр окунался в свои думы, мечтая о мире, правителями которого стали мутанты, homo superior, высшая раса. Самого Чарльза смущала такая перспектива. Теория превосходства рас уже показывала свое лицо, и уж Эрик знал это чуть ли не лучше всех остальных. Тем не менее, переубедить его было, похоже, нереально даже для телепата, вроде Чарли. Да и хотя бы одна мысль о внушении чего-либо Эрику с помощью своих сил казалась Ксавьеру чем-то отвратительным. Он знал, каким другом хочет быть для Леншерра и для всех остальных людей с геном икс. «Никаких манипуляций, только доверие». Казалось бы, простое кредо, но в действительности соблазн использовать свои способности во зло терзал юного профессора каждую минуту, каждое мгновение его жизни. Жить с этим нелегко, но он должен был бороться. Если не ради себя, то ради всех остальных, кого не принимает это жестокое общество.
Звонкий удар о банку пива буквально вырвал Чарльза из размышлений. Сидевший напротив Эрик дружелюбно улыбался, но глаза его указывали на замешательство мужчины.
- О чем ты так задумался, Чарльз? – громко произнес Леншерр, хотя его голос все равно был едва слышен из-за музыки. Ксавьер встрепенулся, рассеянно поглядел на товарища и расплылся в улыбке.
- Я представлял будущее, Эрик. Будущее, в котором испуганные и озлобленные родители не станут отрекаться от своих детей, если у них синяя кожа или парочка ангельских крыльев. Будущее, где мутанты смогут овладеть своими способностями и людям, простым людям, не придется строить бункеры из-за угрозы нападения мутантов. Понимаешь меня, дружище? – говорил повеселевший от алкоголя мутант. Увидев вопросительный взгляд Эрика, молодой человек начал говорить еще быстрее, активно жестикулируя, из-за чего содержимое бутылки расплескивалось в разные стороны. – Черт возьми, да я готов сам учить этих бедных детей, Эрик! Я ведь профессор. Вот и открою школу. Школу для одаренных подростков!
Такое заявление буквально рассмешило собеседника Ксавьера. Он был настроен весьма скептично на этот счет. Но, по правде говоря, Чарльз и не ожидал другого от своего верного товарища. Хотя это не значило, что у телепата не было хотя бы капельки надежды на то, что дорогой ему человек проникнется такой замечательной идеей.
- Знаешь, что нам действительно необходимо, Чарльз? – склонился над столом Магнето, сократив расстояние между ним и собеседником до нескольких десятков сантиметров, - Армия! Когда все эти люди, что окружают тебя, начнут истреблять наших братьев-мутантов, будет уже поздно. Мы должны быть готовы. Мы лучше, Ксавьер, и ты когда-нибудь тоже это поймешь.
Возмущению профессора не было предела. Произошел бы этот разговор на пару бутылок позже, Чарльз бы точно сорвался. Но парню хватило сил сдержаться. Он верил и в себя, и в человечество. Верил в их мирное сосуществование, как бы Эрик не пытался его переубедить. В этом эти двое похожи. Оба упертые идеалисты, пытающиеся перетащить друг друга на свою сторону, понимая при этом, что подобному быть не суждено.
Едва улыбнувшись, Чарльз приподнял сосуд с алкоголем, стукнул им по бутылке друга и сделал пару глотков. Он не стал переубеждать товарища, вступать с ним в долгие дебаты о дальнейшем судьбе мутантов. Ксавьер теперь знал, к чему собирается стремиться. Знал, что когда-нибудь он откроет двери школы для мутантов и в этом радужном будущем будет место каждому, будь он мутантом или обычным человеком. «Даже этот бармен, возможно, найдет место в том мире».